Trước năm 2009, địa bàn huyện Thuận Nam ngày nay thuộc huyện Ninh Phước.

Ngày 10 tháng 6 năm 2009, Chính phủ ban hành Nghị định số 26/NĐ-CP[1]. Theo đó:

• Chia xã Phước Nam thành xã Phước Nam và xã Phước Ninh
• Chia xã Phước Diêm thành xã Phước Diêm và xã Cà Ná
• Tách 8 xã: Cà Ná, Phước Diêm, Phước Ninh, Phước Nam, Phước Minh, Phước Dinh, Nhị Hà, Phước Hà để thành lập huyện Thuận Nam.

Huyện Thuận Nam có 56.452,62 ha diện tích tự nhiên và 54.768 nhân khẩu với 8 đơn vị hành chính cấp xã trực thuộc như hiện nay.